新疆医科大学的前身新疆医学院，是国家“一五”计划156个重点项目之一。1954年7月，新疆医学院开工建设，在党中央关怀下，中央卫生部先后从北京、上海、山东、江苏、辽宁等15个省市抽调上百名教学、医疗、管理干部支援建设。1956年10月，新疆医学院开始招生。1998年6月，新疆医学院与新疆中医学院合并，成立新疆医科大学。2016年8月，新疆维吾尔自治区人民政府、原国家卫生计生委、教育部联合印发《关于共建新疆医科大学的意见》，学校正式成为部委省共建高校。

学校现有2个主校区，下设18个院（部），有8所直属附属医院（临床医学院），7所非隶属临床医学院。另有18所教学医院，95所实习医院，45所专业实习基地。

学校建立了完整的学士、硕士、博士培养体系，涉及医学、理学、工学、管理学、法学5个学科门类。现有5个一级学科博士学位授权点、3个博士专业学位授权点，14个一级学科硕士学位授权点、10个硕士专业学位授权点，4个博士后科研流动站、4个博士后科研工作站，4个学科入选自治区“十四五”重点学科建设序列并顺利通过验收。现有开设29个本科专业，其中有6个国家级特色专业、6个自治区级重点专业，9个国家级一流本科专业建设点，7个自治区级一流本科专业建设点，1个国家级人才培养模式创新实验区。临床医学、药理学与毒理学、生物学与生物化学、免疫学4个学科进入ESI全球排名前1%，其中临床医学是新疆首个跻身ESI全球排名前1%的学科，最新千分位排名为1.81‰，药理学与毒理学、生物学与生物化学、免疫学千分位排名分别为5.63‰、8.64‰和9.67‰。

2021年至今，学校获得各类科研项目4337项，获得经费17.08亿元。其中，纵向项目3420项，经费13.1亿元；横向项目904项，经费3.98亿元。获省部级及以上科技奖114项，何梁何利科学与技术创新奖1项，第十八届中国药学发展奖·创新药物特别贡献奖1项，2025年度教育部科学研究优秀成果奖1项。发表SCI论文4692篇，中文核心期刊论文11797篇，获得授权专利3202项。

学校现有国家级实验教学示范中心2个、国家级临床教学培训示范中心2个、国家级专业技术人员继续教育基地1个，自治区级实验教学示范中心8个、自治区级专业技术人员继续教育基地1个。有省部级及以上科研平台66个，其中国家中医临床研究基地1个，科技部省部共建国家重点实验室1个，科技部国家国际科技合作基地1个，教育部新疆高等研究院（共建）1个，省部共建教育部重点实验室1个，教育部高等学校学科创新引智计划1个，教育部国际合作联合实验室1个，教育部省部共建协同创新中心1个，教育部工程研究中心1个，国家临床医学研究中心分中心9个；自治区重点实验室19个，自治区临床医学研究中心13个，自治区工程技术研究中心6个，“十四五”自治区普通高等学校人文社会科学重点研究基地1个，自治区教育系统铸牢中华民族共同体意识研究与实践基地1个，自治区引才引智示范基地1个，自治区科普教育基地7个等。

现有各类在校生36606人，其中全日制普通本专科生20040人（本科生19642人、专科生398人），硕士研究生5383人，博士研究生923人，专升本和专科层次继续教育学生9451人。

学校是自治区首批来疆留学高校示范基地、首批接受政府奖学金的高校，被教育部授予来华留学生教育先进集体，现有各层次学历教育留学生809人，已培养了来自印度、巴基斯坦、哈萨克斯坦等41个国家的2600余名国际学生。

学校专任教师1703人，其中博士、硕士学位1523人，占比89.43%；高级职称924人，占比54.26%。博士生导师515人，硕士生导师1575人。拥有中国工程院院士1人，全国高校黄大年式教师团队2个，国家级教学名师1人，全国模范教师1人，教育部“长江学者特聘教授”1人，全国中医药高等学校教学名师1人，国医大师1人，全国名中医4人。有自治区级教学名师19人、教学能手18人。5人入选“百千万人才工程”国家级人选，71位专家享受国务院政府特殊津贴。“全国优秀共产党员”2人，“全国劳动模范”4人，“全国五一劳动奖章”获得者10人，“全国民族团结进步模范个人”1人。

学校所辖8所直属附属医院，其中6所为三级甲等医院。8所直属附属医院总占地面积71.96万平方米，建筑面积150.61万平方米，总编制床位9650张，目前共开放床位近1.39万张。现有国家级重点专科27个，自治区重点专科103个，自治区临床研究中心19个。对口支援县级医院30所，覆盖9个地区、22个县市。与602所医院建立医联体协作关系，牵头组建254个专科联盟，搭建358个远程医疗协作网络。

各附属医院集中优势、特色鲜明、错位发展、整体联动，形成了具有较高社会知名度和影响力的医疗资源集群。在新一轮“国考”中，第一附属医院连续五年保持A+等级，稳居全国前10%、全疆第一；附属中医医院综合评价等级为A，进入全国三级中医医院前10%行列。

学校不断加强与国内外知名高校的交流合作，与中南大学、吉林大学、北京中医药大学、中国药科大学、温州医科大学建立了全面对口支援协作关系，与复旦大学、中山大学、兰州大学等30余所大学建立了友好合作关系。与哈萨克斯坦、乌兹别克斯坦、吉尔吉斯斯坦、塔吉克斯坦、俄罗斯、格鲁吉亚、法国等12个国家和地区的60所大学、医疗及科研机构建立了友好合作交流关系。

学校总占地面积171.25万平方米（约2569亩），总建筑面积约121万平方米，其中教学及辅助用房面积约39万平方米。固定资产总值约51亿元，教学科研仪器设备资产值约0.47亿元。图书馆面积约5万平方米，拥有纸质藏书总量187.80万册，电子图书73.80万册，电子期刊81.42万册，学位论文1144.43万册，音视频10852小时，是中国高等教育文献保障系统（CALIS）主要成员馆之一，教育部科技查新工作站，全国专利文南服务网点，国家知识产权信息公共服务网点。学校充分利用物联网、云计算、大数据、泛在感知等信息技术推进“智慧校园”建设，校园内高速网络全覆盖，是国家“绿色数据中心”荣誉称号单位。建有田径场、体育馆、游泳馆、风雨操场、室外球类运动场以及文创中心等多个文体场所。

学校锚定中央赋予新疆的“五大战略”定位，主动服务区域经济社会发展，紧紧围绕人才培养、学科建设、医疗服务三项高质量发展任务，构建“党建、思政、教学、学科、科研、管理、服务、稳定、医疗、国际化”十项工作机制，不断优化学科专业布局和师资队伍结构，提升人才培养、科技创新和医疗服务能力，融入国家战略，服务于新疆经济社会发展需要，努力建设“西部一流、辐射中亚的高水平研究型医科大学”。

（数据截至2025年12月）